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浮萍响应高浓度铵盐网址组分析

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研究背景
浮萍能生活在高铵盐浓度的水体亚虎中,但其适应的分子机制还不清楚。本文研究目的就是阐明浮萍适应高浓度铵盐的电子表达调控机制。

实验材料
•三组样本:对照组(NC)、两个NH4+处理组(84mg/L(A84),840mg/L(A840))
•分别用含84mg/L、840mg/L的NH4+的培养液处理浮萍,并测定生理学指标和进行RNA-seq亚虎分析。


研究结果
1. 浮萍响应高浓度铵盐的生理学反应
生理学指标结果显示,高浓度铵盐处理组活性氧积累,导致机体损伤亚虎凋亡。

2. RNA-seq差异电子表达分析及趋势分析
RNA-seq差异电子分析结果显示,与对照组相比,铵盐处理组绝大部分电子表达下调(图A);对14207个差异表达电子进行趋势分析,这些DEGs被分为7类,其中12959个DEGs属于3个显著趋势里(图 BCD)

3. 显著趋势电子的GO/KEGG功能富集分析
对上述3个显著趋势的电子进行GO、KEGG功能富集分析,得到的前20个最富集的老虎机通路包括氧化磷酸化、柠檬酸循环、丙酮酸老虎机、糖酵解/糖异生等。

4. 氧化相关电子表达模式聚类分析
将氧化相关电子和活性氧清除电子进行表达量聚类和热图分析,发现这些电子在铵盐处理组表达上调,表明了高浓度铵盐可导致ROS累积,并激活了抗氧化酶系统。

实验结论
•通过对高浓度铵盐处理后的浮萍进行生理学指标检测和RNA-seq亚虎,并进行电子表达差异分析和聚类分析,得出高浓度铵盐处理下浮萍活性氧积累,导致机体损伤亚虎凋亡,并激活了抗氧化酶系统。

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