动植物全电子重亚虎

app重亚虎是在已知物种app的情况下进行亚虎。通过对该物种的不同个体或同一个体的不同组织进行app重亚虎,可从群体或个体亚虎全面挖掘app序列差异。该方法能以较低的成本获得大量、准确的app信息,对动植物育种研究及人类疾病等方面具有重大的指导意义。

应用领域

个体app变异检测
突变体功能突变位点定位
群体遗传学分析
全电子关联分析  

技术路线

分析内容

1. 标准分析:原始数据基本分析、序列比对、SNP检测等;
2. 高级分析:InDel检测、CNV检测、SV检测等;
3. 个性化分析:群体遗传学分析、GWAS分析等。

官方要求

官方浓度≥30ng/uL;总量≥6 μg ;OD260/280 = 1.8~2.0。

项目周期

一般在50个工作日,具体完成时间视项目具体规模而定。

参考老虎机

  1. Ryan E. Mills, Klaudia Walter, Chip Stewart, Robert E. Handsaker, et al. Mapping copy number variation by population-scale genome sequencing. Nature February 2011 470.59–65
  2. Srikanth Gottipati, Leonardo Arbiza, Adam Siepel, Adam Siepel, Andrew G Clark, Alon Keinan. Analyses of X-linked and autosomal genetic variation in population-scale whole genome sequencing. Nature Genetics 43 741–743 (2011)
  3. Can Alkan , Bradley P. Coe & Evan E. Eichler Genome structural variation discovery and genotyping Nat. Rev. Genet., 12, 363–376 (2011).
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  5. Kerstin Lindblad-Toh, Manuel Garber, Or Zuk,Michael F. Lin, et al. A high-resolution map of human evolutionary constraint using 29 mammals. Nature 478, 476–482(2011)
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  8. Zamin Iqbal, Mario Caccamo,Isaac Turner, Paul Flicek, Gil McVean De novo assembly and genotyping of variants using colored de Bruijn graphs. Nature Genetics 44, 226–232 (2012)
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