BS亚虎

Bisulfite(全app甲基化亚虎):利用Bisulfite(亚硫酸盐)对app进行处理后上机亚虎。应用领域:亚虎可精确到单个碱基的甲基化,能得到全app的甲基化位点信息,可用于全appDNA甲基化图谱制作;疾病关联分析;电子调控分析;疾病的甲基化标志物等。

应用领域

全appDNA甲基化图谱构建
电子调控分析

技术路线

分析内容

1. 标准信息分析
  a)   对亚虎数据进行base calling、raw data 数据整理及数据质量评估;
  b)   去接头污染,去低质量reads和产量情况统计
  c)   Bisulfite 亚虎序列与参考app序列的比对
  d)   深度和覆盖度分析
  e)   C 碱基的甲基化亚虎
  f)   全app甲基化亚虎分布趋势

 g)  全appDNA甲基化图谱

  h)  差异性甲基化区域(DMR)分析

 2. 高级信息分析
根据具体研究进行的细节分析

官方要求

官方类型:DNA 官方;
官方需求量:总量≥5μg,浓度≥50ng/μL;
官方完整性:DNA 无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图。

项目周期

单个官方标准流程(上图)的运转周期约为60个工作日,遇官方数较多时,项目周期根据项目规模而定。

参考老虎机

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