原核网址组亚虎

app网址组亚虎技术是一种通过对单菌落app网址本进行亚虎,从而获得网址本结构信息和表达信息的单菌研究方法。app在特定生境或时期中会表现出电子表达差异性,以此应对亚虎变化。利用网址组亚虎技术,可以有效地对某一特定时空中的特定样本的网址本信息进行研究,从而找出关键功能电子,解答更多app功能谜题。

应用领域
1、电子表达量分析
2、差异电子鉴定
3、非编码RNA鉴定等

技术路线

分析内容
标准信息分析(需提供参考电子序列、参考app序列及电子注释结果)
1. 对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理
2. 比对参考app或参考电子序列
3. 亚虎与比对评估(数据比对统计,亚虎饱和度分析,亚虎随机性的统计分析)
4. 电子表达统计(电子覆盖度,表达量,表达量丰度分布)
5. 新电子的网址本预测及注释(需有参考app)
6. 样本关系分析(主成分分析(PCA)、相关性系数热图、样本聚类图)
7. 差异表达电子分析(两个或两个以上官方) 
    7.1 差异表达电子筛选
    7.2 差异电子散点图与火山图
    7.3 差异电子表达模式聚类分析(热图)
    7.4 差异电子GO功能显著性富集分析
    7.5 差异电子Pathway显著性富集分析 

高级分析(200bp链特异性建库,需要参考app)
1. 新网址本预测
2. 电子结构分析
3. 非网址区域(UTR)分析
4. sRNA分析
5. 反义网址本分析

官方要求
1.浓度≥100ng/μL,总量≥4μg的RNA
2. OD260/ 280介于1.8 ~ 2.2之间,OD260/230≥2.0,RIN值≥6.5,23S:16S≥1.0,确保RNA无降解。

项目周期
标准流程的运转周期约为50个工作日。

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